A Itepa Faculdades, com o intuito de aprimorar o desempenho acadêmico, oferece um Programa de Nivelamento para acadêmicos que assim desejarem. Este segue duas modalidades: a) para os acadêmicos seminaristas, o nivelamento ocorre, prioritariamente, na Casa de Formação (numa parceria com as Dioceses Mantidas e Conveniadas); b) para os demais acadêmicos é oferecida pela Coordenação Pedagógica e pela Coordenação de Curso, que pede à docentes para acompanharem os discentes ou discentes para subsidiarem outros discentes, auxiliando no desenvolvimento do hábito de leituras na área teológica e na elaboração de textos (memórias de aula, relatório de extensão, registro pastoral/estágio supervisionado, auxílio em informática).